飲咖啡的人較易得膀胱癌，尤其是對女性危害更大。如果將每日只飲半杯或不飲咖啡者患膀胱癌的危險性定為1,那么在每天喝3杯咖啡以上的人中，男性患膀胱癌的危險性為1.31,女性患膀胱癌的危險性為2.19。日本的科研報告也稱，男性胃癌的一些患者中，不少人喜歡飲用咖啡。深圳南山咖啡師培訓班-物語咖啡 。
咖啡因對那些胰島素本來就不夠的人有不良影響，咖啡因對潛在的2型糖尿病患者有不良影響，可能引發2型糖尿病。2型糖尿病是加拿大最普遍的糖尿病，占所有糖尿病患者的90%。要戒掉咖啡因不能過于突然，以免引起類似偏頭痛的毛病或是引發脾氣暴躁。要戒掉咖啡，*采取漸進方式，每天減一些，直到減少到3杯以下為止。深圳南山咖啡師培訓班提醒，減量期間若感到頭痛，暫時還是維持現量，不痛了再繼續減。
吸煙者若每日飲3杯或更多的咖啡，能使他們患胰腺癌的可能性增加4倍。咖啡因對正常細胞有不良的影響，它可促使細胞老化，對胰腺癌的形成有不可忽視的影響，常飲咖啡的人比不飲咖啡的人患胰腺癌的可能性大2-3倍，目前，美國每年大約有2萬人死于胰腺癌，其中至少有半數以上是由于飲用咖啡而引起的。
咖啡中所含的咖啡因成分，具有輕度中樞神經刺激作用，適當飲用可減輕疲勞感、增強記憶、推理及智力，聽覺及視覺反應也變得敏銳。同時深圳南山咖啡師培訓班認為，長期吸收過量咖啡因可能引發高血壓。國際醫學界近來也深入探討咖啡對骨質疏松癥、高血壓、心臟病、減肥、懷孕及早產等健康問題的可能影響。

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