1978年原湖南醫湘西分院并入吉首組建醫療系,1958年創辦的吉首*學校于2000年9月并入吉首,與醫療系合并組建吉首醫。醫組建以后,在學校黨委行政的正確領導下,堅持以教育教學為中心,本著"以*建設為龍頭,以專業建設為基礎,以課程建設為核心,以隊伍建設為重點,以條件建設為"的工作思路,堅持以質量求生存,以改革為動力,以特色樹形象,以上層次、上水平為目標。強化師資隊伍建設,組建*隊伍,提升教師教學與科研水平,加快辦學條件的改善,提高辦學層次,辦學實力不斷增強,教*研水平不斷提升。2012年榮膺批卓越醫生教育培養計劃試點高校。